OpenMP线程和线程MPI

Question

我在思考何时使用 OpenMP 以及何时使用 FDS/Pyrosim 中的 OpenMP 线程 MPI (~"MPI)。我阅读了 FDS 用户指南第 3.3.1 节，但在应用程序上还是不太理解......我希望有人能帮忙！

我目前用于较小运行的机器是 12 GB 内存，带有 4 个物理内核的Xeon e5，在 1 个 CPU 中报告。当我阅读用户指南时，对映射到内核的内容感到很困惑。

使用上面的硬件，假设我有一个带有 4 个网格的模型。我应该为每个内核做一个 MPI 线程，即：

打开 MP 线程：1

打开 MP 线程 MPI：4

开放 MP 栈：200M

或者我应该为每个物理 CPU 执行 1 个 mpi 线程，并为该 CPU 的每个核心执行 1 个 OpenMP 线程？ IE。：

打开 MP 线程：4

打开 MP 线程 MPI：1

开放 MP 栈：200M

MPI 应该是每个核心可用（并行或集群，无论链接什么），还是每个 CPU？

如果每个核心有一个 MPI，我应该尝试让我的网格数量与可用核心数量相匹配，对吗？ （可以理解，密集网格和分布除外）或者 OpenMP 线程是否应该与内核数量相匹配？

 

如果我将机器上的 CPU 加倍为 2 个物理 CPU，每个 CPU 有 4 个内核（总共 8 个内核），那么它会是 8 个 MPI 进程吗？

Answer 1

MPI 使用物理内核之间的并行计算（虚拟内核不可取）。 加速与使用的内核数量有关。 所以理论上你可以在 10 个不同的内核上有 10 个网格，并且模拟的运行速度比一个网格一个内核要快得多。

另一方面，Open MP 通过在几个线程之间划分任务来进行并行计算。 所以加速更加有限。

如果您使用 2 个 MPI 进程，您将获得几乎两倍的速度。 如果您使用 2 OMP，您将获得大约 20-30% 的加速。 如果跳到 8，MPI 的模拟速度将提高 6-7 倍，而 OMP 的速度只会提高一倍。

所以总而言之，根据可用的物理内核使用 MPI。 如果您有可用的虚拟内核，您可以尝试添加 OMP。 对它们进行一些实验以更好地理解。